ساشا شفر در حالی علیه استقلال شکایت کرده که هیچ آورده‌ای برای این باشگاه در طول دوران حضورش در ایران نداشت و فقط به خاطر پدرش بود که توانست با استقلال قرارداد ببندد و صحبت‌ها و اتهامات فراوانی علیه او در استقلال مطرح است.
یکی از کسانی که از پسر وینفرد شفر دل خوشی ندارد، جابر انصاری بازیکن سابق استقلال است که بعد از اختلاف با او چاره‌ای جز جدایی از استقلال نداشت و نه تنها وی، بلکه بسیاری از بازیکنان و حتی بزرگان استقلال را دچار درگیری کرد؛ بازیکن فعلی پیکان درباره ساشا اظهار داشت: کثر معضلات زیر سر پسر شفر بود. ساشا در کل آدم بدجنسی بود و به مرور پرده از اقدامات عجیب آن‌ها برداشته می‌شود.
پیش‌تر مباحثی دربارۀ آلزایمز شفر مطرح بود و گفته می‌شد که پسرش، یعنی ساشا شفر تمامی امور فنی و تصمیمات را به اسم پدر می‌گرفته و دلیل حضور وی در استقلال همین ماجرا بوده است.
