روز شنبه ۲۹ تیر بود که وکیل حمید بقایی از سکته مغزی موکلش خبر داد اما اصغر جهانگیر رئیس سازمان زندان‌ها و اقدامات تامینی و تربیتی گفت که بقایی از هشت روز قبل به مرخصی رفته و در زندان نیست و اگر هم برای او اتفاقی افتاده باشد، سازمان زندان‌ها از آن بی‌اطلاع است.
به گزارش تسنیم قرار بود بقایی روز یکشنبه ۳۰ تیر با پایان یافتن مرخصی هشت روزه خود، مجدد به زندان بازگردد اما مرخصی او تا انتهای هفته جاری تمدید شده و اگر دوباره تمدید نشود، باید روز شنبه هفته آینده خود را به زندان اوین معرفی کند.
البته مهران عبداله پور وکیل بقایی گفته که موکلش ۲۰ روز قبل در زندان سکته کرده و ۱۵ روز بعد تا تایید پزشکان زندان و دریافت مرخصی استعلاجی برای انجام درمان از زندان خارج شده است.
۱۸ خرداد سال ۹۴ بود که حمید بقایی معاون اجرایی محمود احمدی‌نژاد در دولت دهم، با شکایت دولت یازدهم به دادسرا احضار و بازداشت و نهایتا شش ماه بعد یعنی در تاریخ ۲۸ دی ۹۴، با صدور قرار تامین مناسب از زندان آزاد شد.
بر اساس آنچه سخنگوی قوه‌قضاییه در یکی از جلسات نشست خبری هفتگی خود اعلام کرده، تصرف غیرمجاز، تبانی با معاملات غیردولتی، اختلاس و برخی موارد مالی از جمله اتهامات بقایی در این پرونده است.
بقایی شش ماه پس از آزادی از زندان، به خاطر بی توجهی به احضاریه‌های مکرر دادسرا، خرداد ۹۶ بار دیگر بازداشت و چند روز بعد با تودیع وثیقه ۲۰ میلیاردی از زندان شد. او پس از آزادی از زندان، ادعاهایی را در مورد وضعیت برخی زندانیان مطرح کرد؛ ادعاهایی که بنابر اعلام عباس جعفری دولت‌آبادی دادستان وقت تهران دروغ بوده و نهایتاً منجر به تشکیل پرونده جدید برای بقایی شد.
دادگاه رسیدگی به اتهامات بقایی، مهر سال ۹۶ برگزار شد تا اینکه اواخر آبان همان سال دادگاه مبادرت به صدور حکم و او را جمعاً به ۶۳ سال حبس محکوم کرد؛ حبسی که بر اساس ماده ۱۳۴ قانون مجازات اسلامی، ۱۵ سال آن اجرا می‌شود.
بقایی پس از قطعیت یافتن حکم خود، ۲۲ اسفند ۹۶ برای تحمل ۱۵ سال حبس، راهی اوین شد.
او البته از دیوان عالی کشور هم درخواست اعاده دادرسی کرد اما شعبه ۴۰ دیوان عالی کشور، درخواست بقایی را برای اعاده دادرسی نپذیرفت و رد کرد.
